Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc174Q3U155 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc174Q3U155 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms