Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms