Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYU2

Atp13a5, Probable cation-transporting ATPase 13A5, mousemouse

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a5Q3TYU2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp13a5Q3TYU2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Atp13a5Q3TYU2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a5Q3TYU2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a5Q3TYU2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a5Q3TYU2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a5Q3TYU2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a5Q3TYU2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a5Q3TYU2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a5Q3TYU2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a5Q3TYU2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a5Q3TYU2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a5Q3TYU2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a5Q3TYU2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a5Q3TYU2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a5Q3TYU2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a5Q3TYU2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a5Q3TYU2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a5Q3TYU2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a5Q3TYU2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a5Q3TYU2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp13a5Q3TYU2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp13a5Q3TYU2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp13a5Q3TYU2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp13a5Q3TYU2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp13a5Q3TYU2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp13a5Q3TYU2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp13a5Q3TYU2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp13a5Q3TYU2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp13a5Q3TYU2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp13a5Q3TYU2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp13a5Q3TYU2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp13a5Q3TYU2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp13a5Q3TYU2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp13a5Q3TYU2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp13a5Q3TYU2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp13a5Q3TYU2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp13a5Q3TYU2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms