Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWL2

Pip4p1, Type 1 phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 4-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pip4p1Q3TWL2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pip4p1Q3TWL2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms