Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccndbp1Q3TVC7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms