Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TTL0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q3TTL0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TTL0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3TTL0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3TTL0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3TTL0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TTL0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3TTL0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3TTL0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q3TTL0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms