Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT38

D17Wsu92e, Uncharacterized protein C6orf106 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17Wsu92eQ3TT38 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
D17Wsu92eQ3TT38 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
D17Wsu92eQ3TT38 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
D17Wsu92eQ3TT38 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
D17Wsu92eQ3TT38 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
D17Wsu92eQ3TT38 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
D17Wsu92eQ3TT38 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
D17Wsu92eQ3TT38 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
D17Wsu92eQ3TT38 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
D17Wsu92eQ3TT38 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
D17Wsu92eQ3TT38 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
D17Wsu92eQ3TT38 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
D17Wsu92eQ3TT38 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
D17Wsu92eQ3TT38 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
D17Wsu92eQ3TT38 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
D17Wsu92eQ3TT38 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
D17Wsu92eQ3TT38 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
D17Wsu92eQ3TT38 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
D17Wsu92eQ3TT38 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
D17Wsu92eQ3TT38 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
D17Wsu92eQ3TT38 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
D17Wsu92eQ3TT38 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
D17Wsu92eQ3TT38 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
D17Wsu92eQ3TT38 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
D17Wsu92eQ3TT38 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
D17Wsu92eQ3TT38 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
D17Wsu92eQ3TT38 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
D17Wsu92eQ3TT38 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
D17Wsu92eQ3TT38 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
D17Wsu92eQ3TT38 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
D17Wsu92eQ3TT38 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
D17Wsu92eQ3TT38 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
D17Wsu92eQ3TT38 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
D17Wsu92eQ3TT38 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
D17Wsu92eQ3TT38 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
D17Wsu92eQ3TT38 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
D17Wsu92eQ3TT38 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
D17Wsu92eQ3TT38 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
D17Wsu92eQ3TT38 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
D17Wsu92eQ3TT38 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
D17Wsu92eQ3TT38 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
D17Wsu92eQ3TT38 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
D17Wsu92eQ3TT38 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
D17Wsu92eQ3TT38 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
D17Wsu92eQ3TT38 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
D17Wsu92eQ3TT38 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
D17Wsu92eQ3TT38 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
D17Wsu92eQ3TT38 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
D17Wsu92eQ3TT38 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
D17Wsu92eQ3TT38 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
D17Wsu92eQ3TT38 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
D17Wsu92eQ3TT38 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
D17Wsu92eQ3TT38 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
D17Wsu92eQ3TT38 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
D17Wsu92eQ3TT38 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
D17Wsu92eQ3TT38 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
D17Wsu92eQ3TT38 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
D17Wsu92eQ3TT38 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
D17Wsu92eQ3TT38 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
D17Wsu92eQ3TT38 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
D17Wsu92eQ3TT38 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
D17Wsu92eQ3TT38 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
D17Wsu92eQ3TT38 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
D17Wsu92eQ3TT38 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
D17Wsu92eQ3TT38 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
D17Wsu92eQ3TT38 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
D17Wsu92eQ3TT38 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
D17Wsu92eQ3TT38 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
D17Wsu92eQ3TT38 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
D17Wsu92eQ3TT38 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
D17Wsu92eQ3TT38 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
D17Wsu92eQ3TT38 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
D17Wsu92eQ3TT38 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
D17Wsu92eQ3TT38 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
D17Wsu92eQ3TT38 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
D17Wsu92eQ3TT38 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
D17Wsu92eQ3TT38 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
D17Wsu92eQ3TT38 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
D17Wsu92eQ3TT38 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
D17Wsu92eQ3TT38 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
D17Wsu92eQ3TT38 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
D17Wsu92eQ3TT38 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
D17Wsu92eQ3TT38 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
D17Wsu92eQ3TT38 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
D17Wsu92eQ3TT38 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
D17Wsu92eQ3TT38 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
D17Wsu92eQ3TT38 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
D17Wsu92eQ3TT38 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
D17Wsu92eQ3TT38 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
D17Wsu92eQ3TT38 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
D17Wsu92eQ3TT38 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
D17Wsu92eQ3TT38 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
D17Wsu92eQ3TT38 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
D17Wsu92eQ3TT38 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
D17Wsu92eQ3TT38 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
D17Wsu92eQ3TT38 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
D17Wsu92eQ3TT38 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
D17Wsu92eQ3TT38 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
D17Wsu92eQ3TT38 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
D17Wsu92eQ3TT38 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms