Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CiartQ3TQ03 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CiartQ3TQ03 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms