Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL44

Nlrx1, NLR family member X1, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrx1Q3TL44 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nlrx1Q3TL44 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nlrx1Q3TL44 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nlrx1Q3TL44 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nlrx1Q3TL44 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nlrx1Q3TL44 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nlrx1Q3TL44 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nlrx1Q3TL44 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nlrx1Q3TL44 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nlrx1Q3TL44 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlrx1Q3TL44 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlrx1Q3TL44 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlrx1Q3TL44 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlrx1Q3TL44 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlrx1Q3TL44 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlrx1Q3TL44 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrx1Q3TL44 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrx1Q3TL44 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrx1Q3TL44 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrx1Q3TL44 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrx1Q3TL44 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrx1Q3TL44 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrx1Q3TL44 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrx1Q3TL44 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrx1Q3TL44 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms