Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDQ1

Stt3b, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3B, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stt3bQ3TDQ1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Stt3bQ3TDQ1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stt3bQ3TDQ1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stt3bQ3TDQ1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stt3bQ3TDQ1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stt3bQ3TDQ1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stt3bQ3TDQ1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stt3bQ3TDQ1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stt3bQ3TDQ1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stt3bQ3TDQ1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stt3bQ3TDQ1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stt3bQ3TDQ1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stt3bQ3TDQ1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Stt3bQ3TDQ1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms