Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem248Q3TBN1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms