Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-M3Q31093 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms