Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Vax1Q2NKI2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vax1Q2NKI2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms