Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chrna5Q2MKA5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Chrna5Q2MKA5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Chrna5Q2MKA5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chrna5Q2MKA5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chrna5Q2MKA5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chrna5Q2MKA5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chrna5Q2MKA5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chrna5Q2MKA5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chrna5Q2MKA5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chrna5Q2MKA5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Chrna5Q2MKA5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chrna5Q2MKA5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chrna5Q2MKA5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chrna5Q2MKA5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chrna5Q2MKA5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chrna5Q2MKA5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chrna5Q2MKA5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chrna5Q2MKA5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chrna5Q2MKA5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Chrna5Q2MKA5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chrna5Q2MKA5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chrna5Q2MKA5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chrna5Q2MKA5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Chrna5Q2MKA5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chrna5Q2MKA5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chrna5Q2MKA5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chrna5Q2MKA5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrna5Q2MKA5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrna5Q2MKA5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrna5Q2MKA5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrna5Q2MKA5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrna5Q2MKA5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrna5Q2MKA5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrna5Q2MKA5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrna5Q2MKA5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrna5Q2MKA5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrna5Q2MKA5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrna5Q2MKA5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chrna5Q2MKA5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chrna5Q2MKA5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chrna5Q2MKA5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chrna5Q2MKA5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Chrna5Q2MKA5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chrna5Q2MKA5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chrna5Q2MKA5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chrna5Q2MKA5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chrna5Q2MKA5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chrna5Q2MKA5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chrna5Q2MKA5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chrna5Q2MKA5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chrna5Q2MKA5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chrna5Q2MKA5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chrna5Q2MKA5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chrna5Q2MKA5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chrna5Q2MKA5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chrna5Q2MKA5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chrna5Q2MKA5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chrna5Q2MKA5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chrna5Q2MKA5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Chrna5Q2MKA5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chrna5Q2MKA5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms