Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Shroom4Q1W617 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Shroom4Q1W617 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
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Shroom4Q1W617 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Shroom4Q1W617 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Shroom4Q1W617 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Shroom4Q1W617 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Shroom4Q1W617 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Shroom4Q1W617 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Shroom4Q1W617 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Shroom4Q1W617 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Shroom4Q1W617 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Shroom4Q1W617 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Shroom4Q1W617 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Shroom4Q1W617 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Shroom4Q1W617 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Shroom4Q1W617 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Shroom4Q1W617 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Shroom4Q1W617 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Shroom4Q1W617 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Shroom4Q1W617 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Shroom4Q1W617 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Shroom4Q1W617 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms