Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trim71Q1PSW8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim71Q1PSW8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms