Protein–RNA interactions for Protein: Q14DH7

Acss3, Acyl-CoA synthetase short-chain family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acss3Q14DH7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acss3Q14DH7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acss3Q14DH7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acss3Q14DH7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acss3Q14DH7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acss3Q14DH7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acss3Q14DH7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acss3Q14DH7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acss3Q14DH7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acss3Q14DH7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acss3Q14DH7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acss3Q14DH7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acss3Q14DH7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acss3Q14DH7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Acss3Q14DH7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acss3Q14DH7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acss3Q14DH7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acss3Q14DH7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acss3Q14DH7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acss3Q14DH7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acss3Q14DH7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acss3Q14DH7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acss3Q14DH7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acss3Q14DH7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acss3Q14DH7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acss3Q14DH7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acss3Q14DH7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Acss3Q14DH7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acss3Q14DH7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acss3Q14DH7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acss3Q14DH7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acss3Q14DH7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acss3Q14DH7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acss3Q14DH7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acss3Q14DH7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acss3Q14DH7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acss3Q14DH7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Acss3Q14DH7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acss3Q14DH7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms