Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Perm1Q149B8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Perm1Q149B8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Perm1Q149B8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Perm1Q149B8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Perm1Q149B8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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Perm1Q149B8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Perm1Q149B8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Perm1Q149B8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Perm1Q149B8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Perm1Q149B8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Perm1Q149B8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Perm1Q149B8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Perm1Q149B8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Perm1Q149B8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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Perm1Q149B8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Perm1Q149B8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Perm1Q149B8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Perm1Q149B8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Perm1Q149B8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Perm1Q149B8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Perm1Q149B8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Perm1Q149B8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Perm1Q149B8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Perm1Q149B8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Perm1Q149B8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Perm1Q149B8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Perm1Q149B8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Perm1Q149B8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Perm1Q149B8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Perm1Q149B8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Perm1Q149B8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Perm1Q149B8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Perm1Q149B8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Perm1Q149B8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Perm1Q149B8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Perm1Q149B8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Perm1Q149B8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Perm1Q149B8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Perm1Q149B8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Perm1Q149B8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Perm1Q149B8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Perm1Q149B8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Perm1Q149B8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Perm1Q149B8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Perm1Q149B8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Perm1Q149B8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Perm1Q149B8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Perm1Q149B8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Perm1Q149B8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Perm1Q149B8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Perm1Q149B8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Perm1Q149B8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Perm1Q149B8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Perm1Q149B8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Perm1Q149B8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Perm1Q149B8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Perm1Q149B8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
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Perm1Q149B8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Perm1Q149B8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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Perm1Q149B8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Perm1Q149B8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
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Perm1Q149B8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Perm1Q149B8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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Perm1Q149B8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Perm1Q149B8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Perm1Q149B8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Perm1Q149B8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Perm1Q149B8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Perm1Q149B8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Perm1Q149B8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Perm1Q149B8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Perm1Q149B8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Perm1Q149B8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Perm1Q149B8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Perm1Q149B8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Perm1Q149B8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Perm1Q149B8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Perm1Q149B8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Perm1Q149B8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Perm1Q149B8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18■□□□□ 0.47
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Perm1Q149B8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Perm1Q149B8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Perm1Q149B8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Perm1Q149B8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Perm1Q149B8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Perm1Q149B8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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