Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGB7

Ppp4r2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r2Q0VGB7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppp4r2Q0VGB7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppp4r2Q0VGB7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppp4r2Q0VGB7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppp4r2Q0VGB7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppp4r2Q0VGB7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppp4r2Q0VGB7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppp4r2Q0VGB7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppp4r2Q0VGB7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppp4r2Q0VGB7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppp4r2Q0VGB7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppp4r2Q0VGB7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppp4r2Q0VGB7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppp4r2Q0VGB7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppp4r2Q0VGB7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppp4r2Q0VGB7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppp4r2Q0VGB7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppp4r2Q0VGB7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppp4r2Q0VGB7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppp4r2Q0VGB7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppp4r2Q0VGB7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppp4r2Q0VGB7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms