Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG18

Smim24, Small integral membrane protein 24, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim24Q0VG18 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim24Q0VG18 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms