Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb8Q0VBD0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms