Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cntnap5bQ0V8T8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cntnap5bQ0V8T8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cntnap5bQ0V8T8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cntnap5bQ0V8T8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cntnap5bQ0V8T8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cntnap5bQ0V8T8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cntnap5bQ0V8T8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cntnap5bQ0V8T8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cntnap5bQ0V8T8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Cntnap5bQ0V8T8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cntnap5bQ0V8T8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cntnap5bQ0V8T8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cntnap5bQ0V8T8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cntnap5bQ0V8T8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cntnap5bQ0V8T8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cntnap5bQ0V8T8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Cntnap5bQ0V8T8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cntnap5bQ0V8T8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cntnap5bQ0V8T8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cntnap5bQ0V8T8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cntnap5bQ0V8T8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cntnap5bQ0V8T8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cntnap5bQ0V8T8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cntnap5bQ0V8T8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cntnap5bQ0V8T8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cntnap5bQ0V8T8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cntnap5bQ0V8T8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cntnap5bQ0V8T8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cntnap5bQ0V8T8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cntnap5bQ0V8T8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cntnap5bQ0V8T8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Cntnap5bQ0V8T8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cntnap5bQ0V8T8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cntnap5bQ0V8T8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cntnap5bQ0V8T8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Cntnap5bQ0V8T8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Cntnap5bQ0V8T8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cntnap5bQ0V8T8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cntnap5bQ0V8T8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cntnap5bQ0V8T8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cntnap5bQ0V8T8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cntnap5bQ0V8T8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cntnap5bQ0V8T8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cntnap5bQ0V8T8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cntnap5bQ0V8T8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cntnap5bQ0V8T8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cntnap5bQ0V8T8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cntnap5bQ0V8T8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cntnap5bQ0V8T8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cntnap5bQ0V8T8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cntnap5bQ0V8T8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cntnap5bQ0V8T8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cntnap5bQ0V8T8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cntnap5bQ0V8T8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Cntnap5bQ0V8T8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cntnap5bQ0V8T8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cntnap5bQ0V8T8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cntnap5bQ0V8T8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cntnap5bQ0V8T8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cntnap5bQ0V8T8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Cntnap5bQ0V8T8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Cntnap5bQ0V8T8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cntnap5bQ0V8T8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cntnap5bQ0V8T8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cntnap5bQ0V8T8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cntnap5bQ0V8T8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cntnap5bQ0V8T8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cntnap5bQ0V8T8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cntnap5bQ0V8T8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cntnap5bQ0V8T8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Cntnap5bQ0V8T8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cntnap5bQ0V8T8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cntnap5bQ0V8T8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cntnap5bQ0V8T8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cntnap5bQ0V8T8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cntnap5bQ0V8T8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cntnap5bQ0V8T8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cntnap5bQ0V8T8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cntnap5bQ0V8T8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cntnap5bQ0V8T8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cntnap5bQ0V8T8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cntnap5bQ0V8T8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cntnap5bQ0V8T8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cntnap5bQ0V8T8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cntnap5bQ0V8T8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cntnap5bQ0V8T8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cntnap5bQ0V8T8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cntnap5bQ0V8T8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cntnap5bQ0V8T8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cntnap5bQ0V8T8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Cntnap5bQ0V8T8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cntnap5bQ0V8T8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cntnap5bQ0V8T8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cntnap5bQ0V8T8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cntnap5bQ0V8T8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cntnap5bQ0V8T8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms