Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Rab42Q0PD08 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab42Q0PD08 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms