Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Vps8Q0P5W1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Vps8Q0P5W1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Vps8Q0P5W1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Vps8Q0P5W1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Vps8Q0P5W1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Vps8Q0P5W1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vps8Q0P5W1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vps8Q0P5W1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vps8Q0P5W1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vps8Q0P5W1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vps8Q0P5W1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vps8Q0P5W1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vps8Q0P5W1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Vps8Q0P5W1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Vps8Q0P5W1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Vps8Q0P5W1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Vps8Q0P5W1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Vps8Q0P5W1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Vps8Q0P5W1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Vps8Q0P5W1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Vps8Q0P5W1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Vps8Q0P5W1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Vps8Q0P5W1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Vps8Q0P5W1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Vps8Q0P5W1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Vps8Q0P5W1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Vps8Q0P5W1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Vps8Q0P5W1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vps8Q0P5W1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vps8Q0P5W1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vps8Q0P5W1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vps8Q0P5W1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vps8Q0P5W1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vps8Q0P5W1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vps8Q0P5W1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vps8Q0P5W1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vps8Q0P5W1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vps8Q0P5W1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vps8Q0P5W1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vps8Q0P5W1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vps8Q0P5W1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vps8Q0P5W1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vps8Q0P5W1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vps8Q0P5W1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vps8Q0P5W1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vps8Q0P5W1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vps8Q0P5W1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vps8Q0P5W1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vps8Q0P5W1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vps8Q0P5W1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vps8Q0P5W1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Vps8Q0P5W1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Vps8Q0P5W1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Vps8Q0P5W1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Vps8Q0P5W1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Vps8Q0P5W1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Vps8Q0P5W1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Vps8Q0P5W1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms