Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Neurl1bQ0MW30 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Neurl1bQ0MW30 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms