Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubxn2bQ0KL01 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ubxn2bQ0KL01 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms