Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ttc21bQ0HA38 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ttc21bQ0HA38 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ttc21bQ0HA38 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ttc21bQ0HA38 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ttc21bQ0HA38 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ttc21bQ0HA38 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ttc21bQ0HA38 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttc21bQ0HA38 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttc21bQ0HA38 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttc21bQ0HA38 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttc21bQ0HA38 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttc21bQ0HA38 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttc21bQ0HA38 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttc21bQ0HA38 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
Ttc21bQ0HA38 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ttc21bQ0HA38 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms