Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
1700061G19RikQ08EE8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms