Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ssrp1Q08943 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ssrp1Q08943 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms