Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc4Q08624 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms