Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tff1Q08423 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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