Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tgm3Q08189 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms