Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnn2Q08093 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnn2Q08093 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms