Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
F13bQ07968 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
F13bQ07968 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
F13bQ07968 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
F13bQ07968 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
F13bQ07968 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
F13bQ07968 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
F13bQ07968 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
F13bQ07968 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
F13bQ07968 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
F13bQ07968 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
F13bQ07968 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
F13bQ07968 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
F13bQ07968 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
F13bQ07968 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
F13bQ07968 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
F13bQ07968 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
F13bQ07968 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
F13bQ07968 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
F13bQ07968 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
F13bQ07968 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
F13bQ07968 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
F13bQ07968 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
F13bQ07968 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
F13bQ07968 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
F13bQ07968 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
F13bQ07968 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
F13bQ07968 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F13bQ07968 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
F13bQ07968 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
F13bQ07968 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms