Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ebf1Q07802 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ebf1Q07802 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms