Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SrstQ06666 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrstQ06666 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrstQ06666 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrstQ06666 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrstQ06666 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrstQ06666 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms