Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sh3bp2Q06649 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bp2Q06649 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms