Protein–RNA interactions for Protein: Q06180

Ptpn2, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 2, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn2Q06180 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptpn2Q06180 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptpn2Q06180 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptpn2Q06180 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptpn2Q06180 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptpn2Q06180 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptpn2Q06180 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptpn2Q06180 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptpn2Q06180 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptpn2Q06180 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptpn2Q06180 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptpn2Q06180 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptpn2Q06180 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptpn2Q06180 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptpn2Q06180 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptpn2Q06180 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptpn2Q06180 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptpn2Q06180 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptpn2Q06180 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms