Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms