Protein–RNA interactions for Protein: Q05A36

Mex3c, RNA-binding E3 ubiquitin-protein ligase MEX3C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mex3cQ05A36 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mex3cQ05A36 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mex3cQ05A36 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mex3cQ05A36 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms