Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r236Q05A06 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms