Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thbs3Q05895 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms