Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sox12Q04890 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sox12Q04890 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sox12Q04890 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Sox12Q04890 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sox12Q04890 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sox12Q04890 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sox12Q04890 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sox12Q04890 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sox12Q04890 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sox12Q04890 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sox12Q04890 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sox12Q04890 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sox12Q04890 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Sox12Q04890 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Sox12Q04890 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sox12Q04890 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sox12Q04890 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sox12Q04890 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Sox12Q04890 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sox12Q04890 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sox12Q04890 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Sox12Q04890 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Sox12Q04890 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sox12Q04890 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sox12Q04890 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sox12Q04890 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sox12Q04890 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sox12Q04890 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sox12Q04890 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sox12Q04890 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sox12Q04890 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sox12Q04890 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sox12Q04890 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms