Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sox9Q04887 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms