Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Top1Q04750 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Top1Q04750 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Top1Q04750 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Top1Q04750 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Top1Q04750 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Top1Q04750 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Top1Q04750 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Top1Q04750 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top1Q04750 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Top1Q04750 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Top1Q04750 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Top1Q04750 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms