Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Tff2Q03404 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tff2Q03404 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms