Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msx2Q03358 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msx2Q03358 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms