Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mmp11Q02853 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms