Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax5Q02650 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms