Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GscQ02591 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GscQ02591 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GscQ02591 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GscQ02591 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GscQ02591 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GscQ02591 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GscQ02591 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GscQ02591 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GscQ02591 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GscQ02591 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GscQ02591 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GscQ02591 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GscQ02591 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GscQ02591 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GscQ02591 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GscQ02591 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GscQ02591 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GscQ02591 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GscQ02591 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GscQ02591 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GscQ02591 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GscQ02591 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GscQ02591 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GscQ02591 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GscQ02591 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GscQ02591 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GscQ02591 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GscQ02591 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GscQ02591 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GscQ02591 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GscQ02591 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GscQ02591 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GscQ02591 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GscQ02591 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GscQ02591 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GscQ02591 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GscQ02591 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GscQ02591 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GscQ02591 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GscQ02591 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GscQ02591 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GscQ02591 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GscQ02591 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GscQ02591 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GscQ02591 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GscQ02591 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GscQ02591 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GscQ02591 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GscQ02591 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GscQ02591 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GscQ02591 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GscQ02591 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GscQ02591 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GscQ02591 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GscQ02591 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GscQ02591 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GscQ02591 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GscQ02591 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GscQ02591 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GscQ02591 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GscQ02591 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GscQ02591 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GscQ02591 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GscQ02591 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GscQ02591 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GscQ02591 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GscQ02591 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GscQ02591 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GscQ02591 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GscQ02591 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GscQ02591 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GscQ02591 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GscQ02591 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GscQ02591 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GscQ02591 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GscQ02591 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GscQ02591 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GscQ02591 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GscQ02591 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GscQ02591 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GscQ02591 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GscQ02591 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GscQ02591 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GscQ02591 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GscQ02591 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GscQ02591 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GscQ02591 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GscQ02591 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GscQ02591 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GscQ02591 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GscQ02591 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GscQ02591 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GscQ02591 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GscQ02591 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GscQ02591 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GscQ02591 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GscQ02591 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GscQ02591 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GscQ02591 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms